基因工程所用的克隆载体是一种可携带外源DNA分子进入宿主细胞的DNA分子，与宿主细胞的染色体DNA分子相比，它们一般都比较小。目前常用的有质粒、噬菌体或病毒和染色体三类载体，根据目的的基因和宿主的不同，一般采用的载体也不尽相同。